Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMFO60524 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEMFO60524 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEMFO60524 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEMFO60524 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMFO60524 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMFO60524 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMFO60524 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMFO60524 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMFO60524 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMFO60524 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEMFO60524 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEMFO60524 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEMFO60524 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEMFO60524 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEMFO60524 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEMFO60524 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEMFO60524 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEMFO60524 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEMFO60524 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEMFO60524 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEMFO60524 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEMFO60524 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEMFO60524 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEMFO60524 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEMFO60524 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEMFO60524 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEMFO60524 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMFO60524 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMFO60524 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMFO60524 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMFO60524 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEMFO60524 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMFO60524 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMFO60524 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMFO60524 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMFO60524 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMFO60524 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEMFO60524 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMFO60524 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMFO60524 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMFO60524 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMFO60524 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMFO60524 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMFO60524 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEMFO60524 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEMFO60524 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEMFO60524 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEMFO60524 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEMFO60524 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMFO60524 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMFO60524 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMFO60524 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMFO60524 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMFO60524 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEMFO60524 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEMFO60524 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEMFO60524 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEMFO60524 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEMFO60524 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEMFO60524 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEMFO60524 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEMFO60524 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEMFO60524 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEMFO60524 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEMFO60524 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEMFO60524 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEMFO60524 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEMFO60524 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEMFO60524 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NEMFO60524 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEMFO60524 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEMFO60524 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEMFO60524 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEMFO60524 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEMFO60524 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEMFO60524 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEMFO60524 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEMFO60524 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NEMFO60524 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEMFO60524 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEMFO60524 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEMFO60524 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEMFO60524 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEMFO60524 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEMFO60524 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEMFO60524 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEMFO60524 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEMFO60524 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEMFO60524 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEMFO60524 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEMFO60524 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEMFO60524 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEMFO60524 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEMFO60524 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEMFO60524 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NEMFO60524 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEMFO60524 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEMFO60524 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEMFO60524 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms