Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNCRIPO60506 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SYNCRIPO60506 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNCRIPO60506 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms