Protein–RNA interactions for Protein: O00622

CYR61, Protein CYR61, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYR61O00622 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYR61O00622 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYR61O00622 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYR61O00622 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYR61O00622 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYR61O00622 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYR61O00622 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYR61O00622 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYR61O00622 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYR61O00622 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYR61O00622 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYR61O00622 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYR61O00622 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYR61O00622 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYR61O00622 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYR61O00622 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYR61O00622 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYR61O00622 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYR61O00622 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYR61O00622 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CYR61O00622 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CYR61O00622 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYR61O00622 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYR61O00622 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYR61O00622 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYR61O00622 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYR61O00622 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYR61O00622 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYR61O00622 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYR61O00622 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYR61O00622 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYR61O00622 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYR61O00622 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYR61O00622 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYR61O00622 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYR61O00622 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYR61O00622 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYR61O00622 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYR61O00622 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYR61O00622 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYR61O00622 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYR61O00622 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYR61O00622 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYR61O00622 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYR61O00622 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYR61O00622 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYR61O00622 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYR61O00622 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYR61O00622 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYR61O00622 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYR61O00622 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYR61O00622 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYR61O00622 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYR61O00622 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYR61O00622 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYR61O00622 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYR61O00622 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYR61O00622 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYR61O00622 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYR61O00622 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYR61O00622 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYR61O00622 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYR61O00622 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYR61O00622 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYR61O00622 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYR61O00622 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYR61O00622 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYR61O00622 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYR61O00622 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYR61O00622 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYR61O00622 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYR61O00622 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYR61O00622 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYR61O00622 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYR61O00622 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYR61O00622 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYR61O00622 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYR61O00622 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYR61O00622 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYR61O00622 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYR61O00622 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYR61O00622 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYR61O00622 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYR61O00622 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYR61O00622 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYR61O00622 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CYR61O00622 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYR61O00622 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYR61O00622 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYR61O00622 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CYR61O00622 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CYR61O00622 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYR61O00622 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYR61O00622 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CYR61O00622 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYR61O00622 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYR61O00622 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYR61O00622 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYR61O00622 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CYR61O00622 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms