Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GOLIM4O00461 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GOLIM4O00461 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GOLIM4O00461 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms