Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HHLA1C9JL84 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HHLA1C9JL84 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HHLA1C9JL84 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms