Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CYSRT1A8MQ03 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYSRT1A8MQ03 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYSRT1A8MQ03 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYSRT1A8MQ03 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms