Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM187AA6NFU0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM187AA6NFU0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM187AA6NFU0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms