Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SEC24CP53992 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms