Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FARSAQ9Y285 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FARSAQ9Y285 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FARSAQ9Y285 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms