Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HPS5Q9UPZ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
HPS5Q9UPZ3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
HPS5Q9UPZ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HPS5Q9UPZ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms