Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNFSF18Q9UNG2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TNFSF18Q9UNG2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNFSF18Q9UNG2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms