Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXNB3Q9ULL4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PLXNB3Q9ULL4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLXNB3Q9ULL4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms