Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC23Q9UJX2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC23Q9UJX2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms