Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXD3Q9UJU5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXD3Q9UJU5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD3Q9UJU5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 439.1 ms