Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SELENOOQ9BVL4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SELENOOQ9BVL4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SELENOOQ9BVL4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms