Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GINS4Q9BRT9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GINS4Q9BRT9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GINS4Q9BRT9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms