Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MYCBPQ99417 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYCBPQ99417 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYCBPQ99417 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms