Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACCSQ96QU6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACCSQ96QU6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACCSQ96QU6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACCSQ96QU6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms