Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00208Q96KT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00208Q96KT6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
LINC00208Q96KT6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms