Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKD1Q969G9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKD1Q969G9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKD1Q969G9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms