Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC13A3Q8WWT9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC13A3Q8WWT9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC13A3Q8WWT9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms