Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL3Q8TAT5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL3Q8TAT5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NEIL3Q8TAT5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms