Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00612Q8N6U2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00612Q8N6U2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LINC00612Q8N6U2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms