Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCDC82Q8N4S0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC82Q8N4S0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC82Q8N4S0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.8 ms