Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C6

NIN, Ninein, humanhuman

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINQ8N4C6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NINQ8N4C6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NINQ8N4C6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINQ8N4C6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.3 ms