Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC6BQ86SZ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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