Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SCGB1D4Q6XE38 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB1D4Q6XE38 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB1D4Q6XE38 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB1D4Q6XE38 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB1D4Q6XE38 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB1D4Q6XE38 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB1D4Q6XE38 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB1D4Q6XE38 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB1D4Q6XE38 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB1D4Q6XE38 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms