Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAMD4BQ5PRF9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAMD4BQ5PRF9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SAMD4BQ5PRF9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms