Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3M2

SLC5A9, Sodium/glucose cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A9Q2M3M2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC5A9Q2M3M2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC5A9Q2M3M2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC5A9Q2M3M2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC5A9Q2M3M2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms