Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CCDC27Q2M243 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
CCDC27Q2M243 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC27Q2M243 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC27Q2M243 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CCDC27Q2M243 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms