Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ISXQ2M1V0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ISXQ2M1V0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ISXQ2M1V0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ISXQ2M1V0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms