Protein–RNA interactions for Protein: Q1HG43

DUOXA1, Dual oxidase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOXA1Q1HG43 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DUOXA1Q1HG43 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DUOXA1Q1HG43 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DUOXA1Q1HG43 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms