Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRJQ12913 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPRJQ12913 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRJQ12913 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
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