Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 SMF3YLR034C 1422 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 MPC54YOR177C 1395 nt7.06□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 PPM2YOL141W 2088 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 RKM4YDR257C 1485 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 HOG1YLR113W 1308 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 CDC13YDL220C 2775 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 CBS1YDL069C 690 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 PPH22YDL188C 1134 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 ORM1YGR038W 669 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 YHC3YJL059W 1227 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 ARG3YJL088W 1017 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 ATG36YJL185C 882 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 AAD14YNL331C 1131 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 SEC62YPL094C 825 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 YHR020WYHR020W 2067 nt7.05□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 PAF1YBR279W 1338 nt7.04□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.04□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 PFA4YOL003C 1137 nt7.04□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 YDR008CYDR008C 351 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 MCM21YDR318W 1107 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 DCD1YHR144C 939 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 SUI2YJR007W 915 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 YJR096WYJR096W 849 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 GCN3YKR026C 918 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 SWD1YAR003W 1281 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 DPH5YLR172C 903 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 NDL1YLR254C 570 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 RQC1YDR333C 2172 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 CIT3YPR001W 1461 nt7.03□□□□□ -1.28
PUF3Q07807 YCR006CYCR006C 474 nt7.02□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 PCL9YDL179W 915 nt7.02□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 ADH4YGL256W 1149 nt7.02□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 MRP13YGR084C 1020 nt7.02□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF3Q07807 XPT1YJR133W 630 nt7.02□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF3Q07807 IRC11YOR013W 471 nt7.02□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 TIF5YPR041W 1218 nt7.02□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 OPI11YPR044C 354 nt7.02□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 ASR1YPR093C 867 nt7.02□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 GPH1YPR160W 2709 nt7.02□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 SNU71YGR013W 1863 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 COX15YER141W 1461 nt7.01□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF3Q07807 BTT1YDR252W 450 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 DIN7YDR263C 1293 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 ERP5YHR110W 639 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 LDB7YBL006C 543 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 SLZ1YNL196C 897 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 RPL5YPL131W 894 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 ALG5YPL227C 1005 nt7.01□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 YOR389WYOR389W 1875 nt7□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 FCY22YER060W-A 1593 nt7□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 MDM10YAL010C 1482 nt7□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 PEX31YGR004W 1389 nt7□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 HVG1YER039C 750 nt7□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 HOC1YJR075W 1191 nt7□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 YLR366WYLR366W 306 nt7□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 TAP42YMR028W 1101 nt7□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 BIO3YNR058W 1443 nt7□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 HAL5YJL165C 2568 nt7□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 PEX7YDR142C 1128 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 SCEIQ0160 708 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 YLR202CYLR202C 327 nt6.99□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF3Q07807 YMR181CYMR181C 465 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 RNH1YMR234W 1047 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 MTQ1YNL063W 945 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 SLA2YNL243W 2907 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 PLB3YOL011W 2061 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 YLL066CYLL066C 3618 nt6.99□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 ESC2YDR363W 1371 nt6.98□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF3Q07807 GET3YDL100C 1065 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 AIM23YJL131C 1071 nt6.98□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF3Q07807 CUE4YML101C 354 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 PPA2YMR267W 933 nt6.98□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF3Q07807 END3YNL084C 1050 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 DOT1YDR440W 1749 nt6.98□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 TRR1YDR353W 960 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 DYS1YHR068W 1164 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 SPO12YHR152W 522 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 LIA1YJR070C 978 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 YJR107WYJR107W 987 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 MTR2YKL186C 555 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 CTL1YMR180C 963 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 COQ1YBR003W 1422 nt6.97□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF3Q07807 ADH5YBR145W 1056 nt6.97□□□□□ -1.29
PUF3Q07807 SSC1YJR045C 1965 nt6.97□□□□□ -1.29 RIP-Chip
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