Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLOD1Q02809 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PLOD1Q02809 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLOD1Q02809 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms