Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CNTNAP1P78357 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CNTNAP1P78357 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP1P78357 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms