Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNNC1P63316 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNNC1P63316 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNNC1P63316 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNNC1P63316 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms