Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HERVK_113P62684 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HERVK_113P62684 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HERVK_113P62684 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HERVK_113P62684 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms