Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
ROMO1P60602 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ROMO1P60602 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms