Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AIF1P55008 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
AIF1P55008 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AIF1P55008 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
AIF1P55008 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AIF1P55008 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AIF1P55008 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AIF1P55008 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AIF1P55008 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AIF1P55008 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
AIF1P55008 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AIF1P55008 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AIF1P55008 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AIF1P55008 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AIF1P55008 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AIF1P55008 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
AIF1P55008 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AIF1P55008 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AIF1P55008 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AIF1P55008 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
AIF1P55008 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AIF1P55008 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AIF1P55008 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AIF1P55008 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AIF1P55008 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AIF1P55008 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AIF1P55008 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AIF1P55008 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AIF1P55008 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AIF1P55008 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AIF1P55008 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AIF1P55008 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AIF1P55008 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AIF1P55008 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AIF1P55008 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AIF1P55008 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AIF1P55008 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AIF1P55008 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AIF1P55008 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AIF1P55008 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AIF1P55008 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AIF1P55008 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AIF1P55008 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AIF1P55008 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AIF1P55008 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AIF1P55008 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
AIF1P55008 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AIF1P55008 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AIF1P55008 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AIF1P55008 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AIF1P55008 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
AIF1P55008 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AIF1P55008 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AIF1P55008 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AIF1P55008 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AIF1P55008 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AIF1P55008 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AIF1P55008 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AIF1P55008 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AIF1P55008 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AIF1P55008 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AIF1P55008 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AIF1P55008 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AIF1P55008 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AIF1P55008 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AIF1P55008 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AIF1P55008 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AIF1P55008 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AIF1P55008 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AIF1P55008 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AIF1P55008 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AIF1P55008 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AIF1P55008 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
AIF1P55008 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AIF1P55008 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AIF1P55008 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AIF1P55008 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AIF1P55008 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AIF1P55008 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AIF1P55008 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AIF1P55008 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AIF1P55008 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AIF1P55008 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AIF1P55008 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AIF1P55008 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AIF1P55008 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AIF1P55008 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AIF1P55008 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.9 ms