Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN1P53805 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN1P53805 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN1P53805 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN1P53805 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN1P53805 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RCAN1P53805 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RCAN1P53805 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RCAN1P53805 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RCAN1P53805 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RCAN1P53805 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN1P53805 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms