Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCP4P48539 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCP4P48539 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCP4P48539 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCP4P48539 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCP4P48539 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCP4P48539 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PCP4P48539 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCP4P48539 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCP4P48539 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCP4P48539 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCP4P48539 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCP4P48539 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PCP4P48539 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCP4P48539 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCP4P48539 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCP4P48539 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PCP4P48539 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCP4P48539 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCP4P48539 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCP4P48539 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PCP4P48539 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCP4P48539 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCP4P48539 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCP4P48539 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCP4P48539 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCP4P48539 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCP4P48539 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCP4P48539 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCP4P48539 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCP4P48539 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCP4P48539 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCP4P48539 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCP4P48539 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PCP4P48539 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCP4P48539 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PCP4P48539 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCP4P48539 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCP4P48539 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCP4P48539 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCP4P48539 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PCP4P48539 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCP4P48539 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCP4P48539 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PCP4P48539 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCP4P48539 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCP4P48539 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCP4P48539 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCP4P48539 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCP4P48539 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCP4P48539 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCP4P48539 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PCP4P48539 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PCP4P48539 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCP4P48539 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCP4P48539 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCP4P48539 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCP4P48539 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCP4P48539 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCP4P48539 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PCP4P48539 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PCP4P48539 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCP4P48539 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCP4P48539 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PCP4P48539 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCP4P48539 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCP4P48539 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCP4P48539 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PCP4P48539 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCP4P48539 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCP4P48539 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCP4P48539 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCP4P48539 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCP4P48539 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCP4P48539 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCP4P48539 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms