Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP2P32456 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP2P32456 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP2P32456 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP2P32456 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GBP2P32456 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP2P32456 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP2P32456 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP2P32456 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP2P32456 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP2P32456 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP2P32456 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP2P32456 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP2P32456 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GBP2P32456 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP2P32456 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GBP2P32456 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP2P32456 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP2P32456 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP2P32456 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP2P32456 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP2P32456 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GBP2P32456 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP2P32456 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP2P32456 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP2P32456 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP2P32456 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP2P32456 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP2P32456 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP2P32456 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GBP2P32456 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP2P32456 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP2P32456 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP2P32456 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP2P32456 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP2P32456 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP2P32456 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP2P32456 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GBP2P32456 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP2P32456 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP2P32456 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP2P32456 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP2P32456 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP2P32456 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP2P32456 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP2P32456 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GBP2P32456 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP2P32456 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP2P32456 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP2P32456 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP2P32456 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP2P32456 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP2P32456 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP2P32456 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GBP2P32456 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GBP2P32456 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GBP2P32456 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GBP2P32456 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
GBP2P32456 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP2P32456 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP2P32456 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP2P32456 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP2P32456 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP2P32456 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP2P32456 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GBP2P32456 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP2P32456 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP2P32456 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP2P32456 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP2P32456 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GBP2P32456 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP2P32456 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP2P32456 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP2P32456 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GBP2P32456 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP2P32456 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP2P32456 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GBP2P32456 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP2P32456 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP2P32456 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP2P32456 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP2P32456 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP2P32456 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP2P32456 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GBP2P32456 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP2P32456 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP2P32456 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP2P32456 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP2P32456 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP2P32456 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP2P32456 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GBP2P32456 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP2P32456 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP2P32456 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP2P32456 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP2P32456 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GBP2P32456 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP2P32456 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP2P32456 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GBP2P32456 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms