Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FGFR4P22455 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FGFR4P22455 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGFR4P22455 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms