Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGCP20142 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGCP20142 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGCP20142 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PGCP20142 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGCP20142 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGCP20142 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGCP20142 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGCP20142 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PGCP20142 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PGCP20142 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PGCP20142 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGCP20142 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGCP20142 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGCP20142 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PGCP20142 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGCP20142 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGCP20142 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PGCP20142 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGCP20142 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGCP20142 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PGCP20142 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGCP20142 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGCP20142 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGCP20142 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGCP20142 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGCP20142 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PGCP20142 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGCP20142 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGCP20142 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGCP20142 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGCP20142 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGCP20142 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PGCP20142 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGCP20142 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGCP20142 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGCP20142 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGCP20142 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PGCP20142 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGCP20142 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGCP20142 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGCP20142 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGCP20142 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PGCP20142 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGCP20142 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGCP20142 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGCP20142 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGCP20142 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGCP20142 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGCP20142 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGCP20142 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PGCP20142 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGCP20142 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGCP20142 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PGCP20142 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PGCP20142 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGCP20142 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGCP20142 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGCP20142 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGCP20142 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGCP20142 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PGCP20142 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PGCP20142 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGCP20142 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGCP20142 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PGCP20142 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PGCP20142 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PGCP20142 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PGCP20142 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PGCP20142 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms