Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GLI4P10075 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI4P10075 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI4P10075 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI4P10075 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI4P10075 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI4P10075 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI4P10075 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GLI4P10075 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI4P10075 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI4P10075 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI4P10075 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI4P10075 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI4P10075 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI4P10075 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GLI4P10075 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI4P10075 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI4P10075 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI4P10075 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI4P10075 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI4P10075 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI4P10075 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GLI4P10075 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GLI4P10075 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI4P10075 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI4P10075 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI4P10075 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI4P10075 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI4P10075 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI4P10075 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI4P10075 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GLI4P10075 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI4P10075 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI4P10075 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI4P10075 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI4P10075 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI4P10075 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI4P10075 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI4P10075 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GLI4P10075 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI4P10075 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI4P10075 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI4P10075 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI4P10075 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI4P10075 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI4P10075 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI4P10075 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GLI4P10075 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GLI4P10075 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI4P10075 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI4P10075 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI4P10075 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI4P10075 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI4P10075 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI4P10075 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI4P10075 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI4P10075 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GLI4P10075 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI4P10075 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI4P10075 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI4P10075 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI4P10075 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GLI4P10075 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI4P10075 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI4P10075 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI4P10075 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI4P10075 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GLI4P10075 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI4P10075 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI4P10075 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI4P10075 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI4P10075 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI4P10075 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI4P10075 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GLI4P10075 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI4P10075 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI4P10075 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI4P10075 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI4P10075 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GLI4P10075 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms