Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CBSLP0DN79 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CBSLP0DN79 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CBSLP0DN79 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 418.3 ms