Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	TAF9	YMR236W	474 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	COQ3	YOL096C	939 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	snR32	snR32	188 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	ALD6	YPL061W	1503 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	RSC2	YLR357W	2670 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	POX1	YGL205W	2247 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	MRPL1	YDR116C	858 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	LCL3	YGL085W	825 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	VAM7	YGL212W	951 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	MRPS12	YNR036C	462 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	CLP1	YOR250C	1338 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	TAX4	YJL083W	1815 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	SNU71	YGR013W	1863 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	YFL042C	YFL042C	2025 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	UBA1	YKL210W	3075 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	MRC1	YCL061C	3291 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	UTP4	YDR324C	2331 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	YDL085C-A	YDL085C-A	207 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	YGL072C	YGL072C	360 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	YLR296W	YLR296W	327 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	ARA2	YMR041C	1008 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	CTF19	YPL018W	1110 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	DUR1,2	YBR208C	5508 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VAR1	P02381	YFL052W	YFL052W	1398 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	VPS61	YDR136C	573 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	SHO1	YER118C	1104 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	DMA1	YHR115C	1251 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	PHO86	YJL117W	936 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	NRM1	YNR009W	750 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	CCZ1	YBR131W	2115 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	CCT8	YJL008C	1707 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	BUD14	YAR014C	2130 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	QCR8	YJL166W	285 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	PUS4	YNL292W	1212 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	MRPS18	YNL306W	654 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	ENV9	YOR246C	993 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	ECM31	YBR176W	939 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	RAD53	YPL153C	2466 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	YGR054W	YGR054W	1929 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	ARE2	YNR019W	1929 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	DDC1	YPL194W	1839 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	VTH1	YIL173W	4650 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	VTH2	YJL222W	4650 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	MDH3	YDL078C	1032 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	CWC21	YDR482C	408 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	APN1	YKL114C	1104 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	MEH1	YKR007W	555 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	BSC4	YNL269W	396 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	NOP2	YNL061W	1857 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	SAL1	YNL083W	1485 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	VMS1	YDR049W	1899 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	SRP101	YDR292C	1866 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	IES2	YNL215W	963 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	ACS2	YLR153C	2052 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	VAN1	YML115C	1608 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	PRP24	YMR268C	1335 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	HRQ1	YDR291W	3234 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	PPT1	YGR123C	1542 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	GCG1	YER163C	699 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	RPL7A	YGL076C	735 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	OM45	YIL136W	1182 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	LCB3	YJL134W	1230 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	POP5	YAL033W	522 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	COX17	YLL009C	210 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	MSO1	YNR049C	633 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	KTR1	YOR099W	1182 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	RPL7B	YPL198W	735 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	YBR226C	YBR226C	411 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	PGM1	YKL127W	1713 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	PYC2	YBR218C	3543 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	SRL2	YLR082C	1179 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	CMR1	YDL156W	1569 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	VRP1	YLR337C	2454 nt		4.78	□□□□□ -1.64
VAR1	P02381	PWP1	YLR196W	1731 nt		4.77	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	SFB3	YHR098C	2790 nt		4.77	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	PHM8	YER037W	966 nt		4.77	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	MHT1	YLL062C	975 nt		4.77	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	GTO3	YMR251W	1101 nt		4.77	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	TFB4	YPR056W	1017 nt		4.77	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	ZWF1	YNL241C	1518 nt		4.77	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	KEX2	YNL238W	2445 nt		4.76	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	GPD2	YOL059W	1323 nt		4.76	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	TNA1	YGR260W	1605 nt		4.76	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	UTP9	YHR196W	1728 nt		4.76	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	PTC3	YBL056W	1407 nt		4.76	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	YPR123C	YPR123C	435 nt		4.76	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	PTC4	YBR125C	1182 nt		4.76	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	ILV6	YCL009C	930 nt		4.76	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	YAP1801	YHR161C	1914 nt		4.76	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	COA1	YIL157C	594 nt		4.75	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	YKR045C	YKR045C	552 nt		4.75	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	PDR16	YNL231C	1056 nt		4.75	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	RPL21A	YBR191W	483 nt		4.75	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	ERG8	YMR220W	1356 nt		4.75	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	SPS22	YCL048W	1392 nt		4.75	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	FOB1	YDR110W	1701 nt		4.75	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	RGT1	YKL038W	3513 nt		4.74	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	CHS5	YLR330W	2016 nt		4.74	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	IMG1	YCR046C	510 nt		4.74	□□□□□ -1.65
VAR1	P02381	YIL029W-A	YIL029W-A	372 nt		4.74	□□□□□ -1.65

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