Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNSO60931 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNSO60931 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNSO60931 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNSO60931 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNSO60931 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNSO60931 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNSO60931 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNSO60931 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNSO60931 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNSO60931 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNSO60931 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNSO60931 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNSO60931 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNSO60931 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNSO60931 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNSO60931 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNSO60931 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNSO60931 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNSO60931 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNSO60931 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNSO60931 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNSO60931 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNSO60931 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNSO60931 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNSO60931 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNSO60931 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNSO60931 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNSO60931 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNSO60931 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNSO60931 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNSO60931 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNSO60931 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNSO60931 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNSO60931 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNSO60931 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNSO60931 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNSO60931 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNSO60931 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNSO60931 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNSO60931 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNSO60931 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNSO60931 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNSO60931 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNSO60931 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNSO60931 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNSO60931 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNSO60931 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNSO60931 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNSO60931 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNSO60931 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNSO60931 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNSO60931 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNSO60931 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNSO60931 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNSO60931 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNSO60931 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNSO60931 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTNSO60931 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNSO60931 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNSO60931 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNSO60931 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNSO60931 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNSO60931 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNSO60931 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTNSO60931 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNSO60931 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNSO60931 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNSO60931 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNSO60931 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTNSO60931 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNSO60931 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNSO60931 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNSO60931 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNSO60931 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTNSO60931 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms