Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DHX16O60231 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DHX16O60231 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DHX16O60231 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DHX16O60231 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DHX16O60231 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DHX16O60231 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DHX16O60231 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
DHX16O60231 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DHX16O60231 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DHX16O60231 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DHX16O60231 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DHX16O60231 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DHX16O60231 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DHX16O60231 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DHX16O60231 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DHX16O60231 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX16O60231 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX16O60231 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX16O60231 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX16O60231 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX16O60231 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX16O60231 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX16O60231 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX16O60231 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DHX16O60231 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DHX16O60231 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DHX16O60231 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
DHX16O60231 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DHX16O60231 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DHX16O60231 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DHX16O60231 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DHX16O60231 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
DHX16O60231 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DHX16O60231 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DHX16O60231 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DHX16O60231 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DHX16O60231 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DHX16O60231 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DHX16O60231 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DHX16O60231 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DHX16O60231 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DHX16O60231 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DHX16O60231 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
DHX16O60231 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DHX16O60231 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DHX16O60231 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX16O60231 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX16O60231 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX16O60231 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX16O60231 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX16O60231 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX16O60231 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX16O60231 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DHX16O60231 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DHX16O60231 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DHX16O60231 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DHX16O60231 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX16O60231 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX16O60231 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX16O60231 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX16O60231 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX16O60231 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX16O60231 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX16O60231 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX16O60231 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX16O60231 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DHX16O60231 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DHX16O60231 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DHX16O60231 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DHX16O60231 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DHX16O60231 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DHX16O60231 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
DHX16O60231 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DHX16O60231 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DHX16O60231 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DHX16O60231 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DHX16O60231 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DHX16O60231 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DHX16O60231 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
DHX16O60231 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DHX16O60231 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DHX16O60231 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DHX16O60231 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DHX16O60231 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DHX16O60231 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX16O60231 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX16O60231 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX16O60231 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms